Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabpb2P81069 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabpb2P81069 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms