Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Polr1bP70700 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms