Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcr4P70658 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cxcr4P70658 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cxcr4P70658 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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