Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rad50P70388 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms