Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ufd1P70362 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ufd1P70362 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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