Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb7P70195 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb7P70195 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb7P70195 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb7P70195 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb7P70195 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb7P70195 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms