Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SbdsP70122 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SbdsP70122 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms