Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rab3cP62823 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab3cP62823 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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