Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tbpl1P62340 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms