Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp46P62069 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp46P62069 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp46P62069 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms