Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Depdc5P61460 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Depdc5P61460 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms