Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr2iP60898 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr2iP60898 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms