Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap25P60879 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snap25P60879 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms