Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CirbpP60824 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CirbpP60824 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CirbpP60824 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms