Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Setd4P58467 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Setd4P58467 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Setd4P58467 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms