Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpaP58389 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtpaP58389 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms