Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NcstnP57716 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NcstnP57716 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NcstnP57716 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms