Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp5P56399 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp5P56399 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms