Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pex2P55098 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pex2P55098 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms