Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Faf1P54731 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms