Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upp1P52624 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Upp1P52624 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp1P52624 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms