Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2e3P52483 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2e3P52483 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms