Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CcnfP51944 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CcnfP51944 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms