Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa-rs12P50716 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa-rs12P50716 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms