Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc13P50207 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms