Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmod1P49813 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmod1P49813 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms