Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HpdP49429 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HpdP49429 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HpdP49429 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HpdP49429 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HpdP49429 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HpdP49429 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HpdP49429 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HpdP49429 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HpdP49429 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HpdP49429 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HpdP49429 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HpdP49429 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HpdP49429 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HpdP49429 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms