Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Epb42P49222 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Epb42P49222 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Epb42P49222 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms