Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CitP49025 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CitP49025 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CitP49025 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CitP49025 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms