Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnni3P48787 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms