Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfx2P48379 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx2P48379 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms