Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VdrP48281 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VdrP48281 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VdrP48281 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VdrP48281 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VdrP48281 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VdrP48281 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms