Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrprbP47758 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrprbP47758 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrprbP47758 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms