Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ItgavP43406 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ItgavP43406 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms