Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LtbP41155 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtbP41155 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtbP41155 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms