Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik2P39087 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms