Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lig1P37913 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lig1P37913 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms