Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab23P35288 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab23P35288 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms