Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Htr2cP34968 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr2cP34968 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr2cP34968 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Htr2cP34968 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms