Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc11P31313 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms