Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprmP28828 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprmP28828 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprmP28828 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprmP28828 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprmP28828 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprmP28828 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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