Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl3P27659 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl3P27659 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl3P27659 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl3P27659 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl3P27659 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl3P27659 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms