Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CftrP26361 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CftrP26361 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CftrP26361 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CftrP26361 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CftrP26361 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CftrP26361 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CftrP26361 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CftrP26361 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CftrP26361 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CftrP26361 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CftrP26361 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CftrP26361 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CftrP26361 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CftrP26361 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CftrP26361 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CftrP26361 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms