Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd247P24161 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms