Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gria1P23818 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gria1P23818 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms