Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RarbP22605 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RarbP22605 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RarbP22605 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms