Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clk1P22518 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk1P22518 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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