Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Abcb1aP21447 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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