Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc2P20801 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc2P20801 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms