Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Esr1P19785 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms